1.抗菌肽是动植物体内固有的天然成分，营养性多肽大部分是人工水解蛋白质或者其它方法获得的人造产物；

2.抗菌肽是自然界生物长期进化形成的疾病防御抵抗系统重要成分，是一种抗病因子，具有明显的抗病原体和免疫调节功能的生理活性，营养性多肽是后天非系统中间营养物质，主要用途是提供氨基酸类的营养物质，不具备抗病或者保健功能；

3.抗菌肽是具有相同或者类似结构与理化性质的一个专属门类的生理活性物质，具有统一严格的学术定义和命名，大部分营养性多肽产品之间物质结构与理化性质差异很大，没有共性，不能进行学术归类和统一定义命名。